Persiste la contaminación en refugios pesqueros y puertos de abrigo de Progreso y sus comisarías costeras, debido a la arroja desmedida de basura, agentes limpiadores de embarcaciones y sustancias como aceites y combustibles, ante la falta de conciencia del sector pesquero.

Trabajos de mantenimiento y limpieza de embarcaciones fondeadas en los refugios pesqueros dejan nuevamente a la vista los problemas de contaminación presentes en estos lugares de Progreso y sus comisarías, en donde se puede observar a simple vista la presencia de plásticos flotando en el agua. 

De igual manera se pueden avistar otros materiales sólidos, en donde de igual manera se tiene la presencia de contaminantes líquidos sobre el agua, siendo estos sustancias tóxicas y aceites, detergentes y productos químicos de las naves.